Masjid dan Pembinaan Mental adalah hal yang wajib dibina dan didukung demi terciptanya lulusan D3 Farmasi yang beriman dan bertakwa dan bermoral mulia, di Akademi Farmasi Al-Fatah Bengkulu tersedia Masjid sebagai tempat ibadah dan diberikan juga Pembinaan Mental dan Spiritual bagi seluruh mahasiswa.